MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020054	CTG	2	6	232681	232686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4502	NC_020054	GGT	2	6	232689	232694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833572
4503	NC_020054	TCGA	2	8	232708	232715	25 %	25 %	25 %	25 %	436833572
4504	NC_020054	ATC	2	6	232798	232803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833572
4505	NC_020054	TCA	2	6	232922	232927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833572
4506	NC_020054	CTG	2	6	232942	232947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4507	NC_020054	GTC	2	6	232968	232973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4508	NC_020054	AGGT	2	8	233009	233016	25 %	25 %	50 %	0 %	436833572
4509	NC_020054	GTCG	2	8	233025	233032	0 %	25 %	50 %	25 %	436833572
4510	NC_020054	GAA	2	6	233056	233061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833572
4511	NC_020054	CGG	2	6	233115	233120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833572
4512	NC_020054	GTC	2	6	233140	233145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4513	NC_020054	ACG	2	6	233219	233224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4514	NC_020054	GCT	2	6	233235	233240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833572
4515	NC_020054	GCC	2	6	233244	233249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833572
4516	NC_020054	GAA	2	6	233272	233277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833573
4517	NC_020054	CTG	2	6	233315	233320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4518	NC_020054	TGG	2	6	233395	233400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833573
4519	NC_020054	ACG	2	6	233491	233496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4520	NC_020054	CGA	2	6	233533	233538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4521	NC_020054	CAG	2	6	233546	233551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4522	NC_020054	TCG	2	6	233619	233624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4523	NC_020054	GTT	2	6	233696	233701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833573
4524	NC_020054	CAT	2	6	233720	233725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833573
4525	NC_020054	CGG	2	6	233749	233754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833573
4526	NC_020054	TCT	2	6	233755	233760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833573
4527	NC_020054	TTTC	2	8	233767	233774	0 %	75 %	0 %	25 %	436833573
4528	NC_020054	GCC	2	6	233853	233858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833573
4529	NC_020054	CCG	2	6	233860	233865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833573
4530	NC_020054	ACC	2	6	233883	233888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833573
4531	NC_020054	AGAAGT	2	12	233980	233991	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436833573
4532	NC_020054	CGT	2	6	234014	234019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4533	NC_020054	CAG	2	6	234035	234040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4534	NC_020054	GAG	2	6	234092	234097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833573
4535	NC_020054	CTG	2	6	234122	234127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4536	NC_020054	GCCC	2	8	234142	234149	0 %	0 %	25 %	75 %	436833573
4537	NC_020054	C	7	7	234251	234257	0 %	0 %	0 %	100 %	436833573
4538	NC_020054	CG	4	8	234298	234305	0 %	0 %	50 %	50 %	436833573
4539	NC_020054	GTA	2	6	234326	234331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833573
4540	NC_020054	CAG	2	6	234356	234361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4541	NC_020054	CGT	2	6	234445	234450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4542	NC_020054	CTG	2	6	234554	234559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4543	NC_020054	TGA	2	6	234582	234587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833573
4544	NC_020054	CAG	2	6	234602	234607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4545	NC_020054	CAG	2	6	234611	234616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833573
4546	NC_020054	CCG	2	6	234712	234717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833573
4547	NC_020054	TTG	2	6	234738	234743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833573
4548	NC_020054	TGA	2	6	234763	234768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833573
4549	NC_020054	GCCT	2	8	235246	235253	0 %	25 %	25 %	50 %	436833574
4550	NC_020054	GCCCA	2	10	235256	235265	20 %	0 %	20 %	60 %	436833574
4551	NC_020054	ACG	2	6	235277	235282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4552	NC_020054	G	6	6	235298	235303	0 %	0 %	100 %	0 %	436833574
4553	NC_020054	ATC	2	6	235328	235333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833574
4554	NC_020054	ACT	2	6	235335	235340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833574
4555	NC_020054	CGG	2	6	235343	235348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833574
4556	NC_020054	CTG	2	6	235424	235429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4557	NC_020054	GCCC	2	8	235451	235458	0 %	0 %	25 %	75 %	436833574
4558	NC_020054	GCT	2	6	235471	235476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4559	NC_020054	CAA	2	6	235480	235485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833574
4560	NC_020054	ATG	2	6	235526	235531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833574
4561	NC_020054	CAA	2	6	235555	235560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833574
4562	NC_020054	CAG	2	6	235754	235759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4563	NC_020054	CA	3	6	235834	235839	50 %	0 %	0 %	50 %	436833574
4564	NC_020054	GCCC	2	8	235891	235898	0 %	0 %	25 %	75 %	436833574
4565	NC_020054	GCT	2	6	235975	235980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4566	NC_020054	TGA	2	6	236104	236109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833574
4567	NC_020054	TGC	2	6	236115	236120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4568	NC_020054	CGA	2	6	236142	236147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4569	NC_020054	CAA	2	6	236155	236160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833574
4570	NC_020054	GCC	2	6	236174	236179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833574
4571	NC_020054	GGC	2	6	236260	236265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833574
4572	NC_020054	CTG	2	6	236426	236431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4573	NC_020054	GCT	2	6	236473	236478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4574	NC_020054	CGA	2	6	236500	236505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833574
4575	NC_020054	CGCAGG	2	12	236658	236669	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	436833574
4576	NC_020054	TTC	2	6	236690	236695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833574
4577	NC_020054	GCC	2	6	236750	236755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833574
4578	NC_020054	ACT	2	6	236758	236763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833574
4579	NC_020054	GCT	2	6	237006	237011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833575
4580	NC_020054	CAA	2	6	237072	237077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833575
4581	NC_020054	CTG	2	6	237139	237144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833575
4582	NC_020054	GAA	2	6	237148	237153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833575
4583	NC_020054	CGG	2	6	237257	237262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833575
4584	NC_020054	TCA	2	6	237293	237298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833575
4585	NC_020054	TCG	2	6	237341	237346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833575
4586	NC_020054	ACT	2	6	237492	237497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833576
4587	NC_020054	CCG	2	6	237504	237509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833576
4588	NC_020054	GCC	2	6	237590	237595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833576
4589	NC_020054	CGCC	2	8	237615	237622	0 %	0 %	25 %	75 %	436833576
4590	NC_020054	CGA	2	6	237673	237678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833576
4591	NC_020054	CTCG	2	8	237697	237704	0 %	25 %	25 %	50 %	436833576
4592	NC_020054	AAGC	2	8	237709	237716	50 %	0 %	25 %	25 %	436833576
4593	NC_020054	CGGG	2	8	237738	237745	0 %	0 %	75 %	25 %	436833576
4594	NC_020054	AGC	2	6	237749	237754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833576
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4598	NC_020054	GCCGC	2	10	237869	237878	0 %	0 %	40 %	60 %	436833576
4599	NC_020054	GC	3	6	237890	237895	0 %	0 %	50 %	50 %	436833576
4600	NC_020054	TGG	2	6	237930	237935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833576
4601	NC_020054	CAT	2	6	237979	237984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833576
4602	NC_020054	CGA	2	6	238017	238022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833576
4603	NC_020054	TCA	2	6	238023	238028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833576
4604	NC_020054	GCC	2	6	238061	238066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833576
4605	NC_020054	TGA	2	6	238075	238080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833576
4606	NC_020054	CGA	2	6	238141	238146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833576
4607	NC_020054	CAG	2	6	238384	238389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833577
4608	NC_020054	AAC	2	6	238520	238525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833577
4609	NC_020054	CCG	2	6	238566	238571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833577
4610	NC_020054	GTA	2	6	238585	238590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833577
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4612	NC_020054	CGG	2	6	238645	238650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833577
4613	NC_020054	GATC	2	8	238656	238663	25 %	25 %	25 %	25 %	436833577
4614	NC_020054	GCT	2	6	238801	238806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833577
4615	NC_020054	CCA	2	6	238821	238826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833577
4616	NC_020054	CG	3	6	238935	238940	0 %	0 %	50 %	50 %	436833577
4617	NC_020054	CTGA	2	8	238953	238960	25 %	25 %	25 %	25 %	436833577
4618	NC_020054	A	6	6	239014	239019	100 %	0 %	0 %	0 %	436833577
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4620	NC_020054	ACG	2	6	239093	239098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833577
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4977	NC_020054	TCG	2	6	257803	257808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833590
4978	NC_020054	GTG	2	6	257821	257826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833590
4979	NC_020054	CTT	2	6	257846	257851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833590
4980	NC_020054	CAA	2	6	257897	257902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833590
4981	NC_020054	ATC	2	6	258193	258198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833591
4982	NC_020054	CTGG	2	8	258243	258250	0 %	25 %	50 %	25 %	436833591
4983	NC_020054	CAGC	2	8	258278	258285	25 %	0 %	25 %	50 %	436833591
4984	NC_020054	C	6	6	258329	258334	0 %	0 %	0 %	100 %	436833591
4985	NC_020054	CTG	3	9	258369	258377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833591
4986	NC_020054	TGG	2	6	258389	258394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833591
4987	NC_020054	TGC	2	6	258400	258405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833591
4988	NC_020054	CCT	2	6	258506	258511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833591
4989	NC_020054	CCT	2	6	258530	258535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833591
4990	NC_020054	TTG	2	6	258552	258557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833591
4991	NC_020054	TCG	2	6	258580	258585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833591
4992	NC_020054	TTGA	2	8	258595	258602	25 %	50 %	25 %	0 %	436833591
4993	NC_020054	GTTTA	2	10	258609	258618	20 %	60 %	20 %	0 %	436833591
4994	NC_020054	AAC	2	6	258643	258648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833591
4995	NC_020054	GTC	2	6	258649	258654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833591
4996	NC_020054	CTG	2	6	258783	258788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833591
4997	NC_020054	CCAG	2	8	258907	258914	25 %	0 %	25 %	50 %	436833591
4998	NC_020054	TCG	2	6	259047	259052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833592
4999	NC_020054	CAT	2	6	259064	259069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833592
5000	NC_020054	CAG	2	6	259100	259105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833592

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